纯净时形成无色透明的晶体，当含微量元素Al、Fe等时呈紫色、黄色、茶色等，经辐照微量元素形成不同类型的色心，产生不同的颜色，如紫色、黄色、茶色、粉色等。含伴生包裹体矿物的被称之为包裹体水晶，如发晶、绿幽灵等，内包物为金红石、电气石、阳起石、云母、绿泥石等。

 

　　西方国家认为只要是透明的都是水晶(Crystal)，所以水晶这个词包含了无色透明的玻璃(K9类，普通玻璃发蓝)，也包含天然的水晶矿石。中国古老的水晶名称是水精、水碧、水玉、晶石等十多种称呼，在《和汉三才图会》狻麑阵净化。，因此，为了便于区分，国际上通常以(Rockcrystal)来特指天然水晶。

 

　　发育良好的单晶为六方锥体，所以通常为块状或粒状集合体，一般为无色、灰色、乳白色，含其他矿物元素时呈紫、红、烟、茶等。

 

　　当二氧化硅结晶完美时就是水晶;结晶不完美的就是石英：二氧化硅胶化脱水后就是玛瑙;二氧化硅含水的胶体凝固后就成为蛋白石;二氧化硅晶粒小于几微米时，就组成玉髓、燧石、次生石英岩。